Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms