Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 KCNMA1-227ENST00000638203 3840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 KCNMA1-232ENST00000638306 3811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 KCNMA1-233ENST00000638351 3849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 MARCH3-201ENST00000308660 4196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 SPCS3-201ENST00000503362 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 GPR173-201ENST00000332582 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 PRPF38A-201ENST00000257181 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 PHF19-202ENST00000373896 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 HTR2C-201ENST00000276198 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 SKA3-202ENST00000314759 2919 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 BDH1-201ENST00000358186 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 KCNMA1-265ENST00000639591 3888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 FAM118A-201ENST00000216214 3458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 TBC1D22B-201ENST00000373491 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 C5AR2-201ENST00000595464 6746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 ADAMTSL4-202ENST00000369038 4167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 OR2V1-204ENST00000641551 2423 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 ZNF180-201ENST00000221327 4335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 AL031719.1-201ENST00000623365 2587 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 ALKBH5-201ENST00000399138 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 INIP-203ENST00000374242 4233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 CAPN5-201ENST00000278559 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 SEZ6L-203ENST00000360929 6307 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 C3orf38-201ENST00000318887 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 ZSWIM3-201ENST00000255152 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 AC092143.1-201ENST00000556922 2776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 APOBR-201ENST00000431282 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 RFFL-201ENST00000315249 7293 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 MIR34AHG-203ENST00000635687 4211 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 SIX1-203ENST00000554986 1959 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 FLNA-204ENST00000369856 8241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 VASH2-203ENST00000366965 3572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 CACNB1-202ENST00000394303 3742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 LINC01544-201ENST00000567801 5168 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 PPT2-EGFL8-202ENST00000422437 4181 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 NLGN3-206ENST00000612180 3319 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 PAPLN-203ENST00000554301 4090 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 MAGEL2-201ENST00000532292 4298 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 AC010336.1-201ENST00000539278 4739 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 SMPDL3B-206ENST00000549094 1611 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms