Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC10.82□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms