Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDK5RAP3Q96JB5 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms