Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 SLC46A1-208ENST00000618626 5363 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 FLNC-202ENST00000346177 9042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 MYO7A-202ENST00000409709 7462 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 CSPG4P11-201ENST00000560634 4910 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 TROVE2-208ENST00000432079 7848 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 ASXL1-201ENST00000306058 6591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 PRKAR1A-203ENST00000392711 4327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RNFT2Q96EX2 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 TXLNA-201ENST00000373609 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 ABCB8-202ENST00000358849 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 CLUAP1-202ENST00000571025 5126 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 GOLGA7B-203ENST00000596005 6378 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 AMER2-201ENST00000357816 10055 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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