Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

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Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
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