Protein–RNA interactions for Protein: Q92908

GATA6, Transcription factor GATA-6, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA6Q92908 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GATA6Q92908 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GATA6Q92908 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GATA6Q92908 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GATA6Q92908 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GATA6Q92908 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GATA6Q92908 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GATA6Q92908 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GATA6Q92908 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GATA6Q92908 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GATA6Q92908 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GATA6Q92908 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GATA6Q92908 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GATA6Q92908 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GATA6Q92908 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GATA6Q92908 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GATA6Q92908 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GATA6Q92908 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GATA6Q92908 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GATA6Q92908 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GATA6Q92908 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GATA6Q92908 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GATA6Q92908 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GATA6Q92908 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GATA6Q92908 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GATA6Q92908 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GATA6Q92908 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GATA6Q92908 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GATA6Q92908 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GATA6Q92908 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GATA6Q92908 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
GATA6Q92908 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GATA6Q92908 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GATA6Q92908 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
GATA6Q92908 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
GATA6Q92908 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GATA6Q92908 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GATA6Q92908 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GATA6Q92908 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GATA6Q92908 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GATA6Q92908 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GATA6Q92908 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GATA6Q92908 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GATA6Q92908 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GATA6Q92908 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GATA6Q92908 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GATA6Q92908 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GATA6Q92908 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GATA6Q92908 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GATA6Q92908 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GATA6Q92908 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GATA6Q92908 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GATA6Q92908 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GATA6Q92908 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GATA6Q92908 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GATA6Q92908 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GATA6Q92908 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GATA6Q92908 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GATA6Q92908 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GATA6Q92908 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GATA6Q92908 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GATA6Q92908 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GATA6Q92908 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GATA6Q92908 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GATA6Q92908 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
GATA6Q92908 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GATA6Q92908 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GATA6Q92908 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GATA6Q92908 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GATA6Q92908 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GATA6Q92908 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GATA6Q92908 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
GATA6Q92908 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GATA6Q92908 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GATA6Q92908 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GATA6Q92908 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GATA6Q92908 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GATA6Q92908 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GATA6Q92908 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GATA6Q92908 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GATA6Q92908 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GATA6Q92908 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GATA6Q92908 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GATA6Q92908 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GATA6Q92908 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GATA6Q92908 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GATA6Q92908 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GATA6Q92908 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GATA6Q92908 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GATA6Q92908 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GATA6Q92908 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GATA6Q92908 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GATA6Q92908 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GATA6Q92908 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
GATA6Q92908 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GATA6Q92908 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GATA6Q92908 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GATA6Q92908 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
GATA6Q92908 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
GATA6Q92908 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.6 ms