Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDR0

TRAF3IP1, TRAF3-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP1Q8TDR0 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAF3IP1Q8TDR0 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAF3IP1Q8TDR0 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAF3IP1Q8TDR0 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAF3IP1Q8TDR0 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAF3IP1Q8TDR0 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAF3IP1Q8TDR0 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAF3IP1Q8TDR0 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAF3IP1Q8TDR0 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAF3IP1Q8TDR0 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAF3IP1Q8TDR0 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF3IP1Q8TDR0 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF3IP1Q8TDR0 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF3IP1Q8TDR0 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF3IP1Q8TDR0 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF3IP1Q8TDR0 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF3IP1Q8TDR0 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF3IP1Q8TDR0 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF3IP1Q8TDR0 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF3IP1Q8TDR0 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF3IP1Q8TDR0 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF3IP1Q8TDR0 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF3IP1Q8TDR0 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF3IP1Q8TDR0 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF3IP1Q8TDR0 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF3IP1Q8TDR0 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF3IP1Q8TDR0 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF3IP1Q8TDR0 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF3IP1Q8TDR0 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF3IP1Q8TDR0 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF3IP1Q8TDR0 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF3IP1Q8TDR0 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF3IP1Q8TDR0 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF3IP1Q8TDR0 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF3IP1Q8TDR0 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF3IP1Q8TDR0 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF3IP1Q8TDR0 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF3IP1Q8TDR0 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF3IP1Q8TDR0 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF3IP1Q8TDR0 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF3IP1Q8TDR0 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF3IP1Q8TDR0 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF3IP1Q8TDR0 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF3IP1Q8TDR0 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF3IP1Q8TDR0 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF3IP1Q8TDR0 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF3IP1Q8TDR0 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF3IP1Q8TDR0 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF3IP1Q8TDR0 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF3IP1Q8TDR0 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF3IP1Q8TDR0 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF3IP1Q8TDR0 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF3IP1Q8TDR0 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF3IP1Q8TDR0 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF3IP1Q8TDR0 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF3IP1Q8TDR0 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF3IP1Q8TDR0 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF3IP1Q8TDR0 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF3IP1Q8TDR0 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF3IP1Q8TDR0 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF3IP1Q8TDR0 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF3IP1Q8TDR0 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF3IP1Q8TDR0 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF3IP1Q8TDR0 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF3IP1Q8TDR0 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF3IP1Q8TDR0 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF3IP1Q8TDR0 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF3IP1Q8TDR0 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF3IP1Q8TDR0 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF3IP1Q8TDR0 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF3IP1Q8TDR0 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF3IP1Q8TDR0 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF3IP1Q8TDR0 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF3IP1Q8TDR0 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF3IP1Q8TDR0 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF3IP1Q8TDR0 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF3IP1Q8TDR0 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF3IP1Q8TDR0 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF3IP1Q8TDR0 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF3IP1Q8TDR0 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF3IP1Q8TDR0 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF3IP1Q8TDR0 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF3IP1Q8TDR0 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF3IP1Q8TDR0 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF3IP1Q8TDR0 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF3IP1Q8TDR0 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF3IP1Q8TDR0 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF3IP1Q8TDR0 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF3IP1Q8TDR0 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF3IP1Q8TDR0 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF3IP1Q8TDR0 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF3IP1Q8TDR0 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF3IP1Q8TDR0 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF3IP1Q8TDR0 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF3IP1Q8TDR0 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF3IP1Q8TDR0 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF3IP1Q8TDR0 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF3IP1Q8TDR0 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF3IP1Q8TDR0 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF3IP1Q8TDR0 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms