Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZIC4Q8N9L1 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZIC4Q8N9L1 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZIC4Q8N9L1 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZIC4Q8N9L1 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZIC4Q8N9L1 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZIC4Q8N9L1 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZIC4Q8N9L1 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZIC4Q8N9L1 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZIC4Q8N9L1 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZIC4Q8N9L1 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZIC4Q8N9L1 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZIC4Q8N9L1 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZIC4Q8N9L1 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZIC4Q8N9L1 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ZIC4Q8N9L1 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ZIC4Q8N9L1 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ZIC4Q8N9L1 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ZIC4Q8N9L1 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZIC4Q8N9L1 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZIC4Q8N9L1 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ZIC4Q8N9L1 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZIC4Q8N9L1 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZIC4Q8N9L1 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZIC4Q8N9L1 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZIC4Q8N9L1 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ZIC4Q8N9L1 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZIC4Q8N9L1 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZIC4Q8N9L1 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZIC4Q8N9L1 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZIC4Q8N9L1 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZIC4Q8N9L1 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZIC4Q8N9L1 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZIC4Q8N9L1 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZIC4Q8N9L1 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZIC4Q8N9L1 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZIC4Q8N9L1 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZIC4Q8N9L1 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZIC4Q8N9L1 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZIC4Q8N9L1 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZIC4Q8N9L1 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ZIC4Q8N9L1 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZIC4Q8N9L1 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZIC4Q8N9L1 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZIC4Q8N9L1 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZIC4Q8N9L1 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZIC4Q8N9L1 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZIC4Q8N9L1 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZIC4Q8N9L1 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZIC4Q8N9L1 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZIC4Q8N9L1 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZIC4Q8N9L1 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZIC4Q8N9L1 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZIC4Q8N9L1 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZIC4Q8N9L1 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZIC4Q8N9L1 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZIC4Q8N9L1 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZIC4Q8N9L1 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZIC4Q8N9L1 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZIC4Q8N9L1 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZIC4Q8N9L1 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ZIC4Q8N9L1 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZIC4Q8N9L1 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ZIC4Q8N9L1 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZIC4Q8N9L1 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZIC4Q8N9L1 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZIC4Q8N9L1 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZIC4Q8N9L1 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ZIC4Q8N9L1 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZIC4Q8N9L1 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZIC4Q8N9L1 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZIC4Q8N9L1 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZIC4Q8N9L1 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZIC4Q8N9L1 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZIC4Q8N9L1 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZIC4Q8N9L1 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZIC4Q8N9L1 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ZIC4Q8N9L1 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZIC4Q8N9L1 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZIC4Q8N9L1 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZIC4Q8N9L1 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZIC4Q8N9L1 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZIC4Q8N9L1 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZIC4Q8N9L1 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZIC4Q8N9L1 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZIC4Q8N9L1 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZIC4Q8N9L1 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZIC4Q8N9L1 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZIC4Q8N9L1 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZIC4Q8N9L1 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZIC4Q8N9L1 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZIC4Q8N9L1 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZIC4Q8N9L1 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZIC4Q8N9L1 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZIC4Q8N9L1 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZIC4Q8N9L1 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZIC4Q8N9L1 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZIC4Q8N9L1 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZIC4Q8N9L1 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZIC4Q8N9L1 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms