Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU7

SCX, Basic helix-loop-helix transcription factor scleraxis, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCXQ7RTU7 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 INSRR-201ENST00000368195 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 EPHB1-201ENST00000398015 4672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 AC073957.3-201ENST00000609998 6758 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 SPG11-202ENST00000427534 6935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 NFATC2-201ENST00000371564 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 DNM3-202ENST00000367731 7613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 ZIK1-204ENST00000597850 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 PER3-208ENST00000613533 6318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 PLA2G4F-202ENST00000397272 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SCXQ7RTU7 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms