Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms