Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATG16L1Q676U5 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
ATG16L1Q676U5 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
ATG16L1Q676U5 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATG16L1Q676U5 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATG16L1Q676U5 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
ATG16L1Q676U5 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATG16L1Q676U5 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATG16L1Q676U5 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATG16L1Q676U5 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATG16L1Q676U5 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATG16L1Q676U5 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATG16L1Q676U5 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATG16L1Q676U5 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATG16L1Q676U5 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
ATG16L1Q676U5 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATG16L1Q676U5 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATG16L1Q676U5 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATG16L1Q676U5 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATG16L1Q676U5 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATG16L1Q676U5 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATG16L1Q676U5 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATG16L1Q676U5 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATG16L1Q676U5 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATG16L1Q676U5 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATG16L1Q676U5 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATG16L1Q676U5 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATG16L1Q676U5 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATG16L1Q676U5 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATG16L1Q676U5 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATG16L1Q676U5 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATG16L1Q676U5 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATG16L1Q676U5 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATG16L1Q676U5 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATG16L1Q676U5 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATG16L1Q676U5 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATG16L1Q676U5 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATG16L1Q676U5 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATG16L1Q676U5 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
ATG16L1Q676U5 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATG16L1Q676U5 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATG16L1Q676U5 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATG16L1Q676U5 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATG16L1Q676U5 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
ATG16L1Q676U5 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
ATG16L1Q676U5 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATG16L1Q676U5 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATG16L1Q676U5 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATG16L1Q676U5 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATG16L1Q676U5 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATG16L1Q676U5 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATG16L1Q676U5 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATG16L1Q676U5 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATG16L1Q676U5 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATG16L1Q676U5 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATG16L1Q676U5 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATG16L1Q676U5 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATG16L1Q676U5 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATG16L1Q676U5 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATG16L1Q676U5 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATG16L1Q676U5 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATG16L1Q676U5 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATG16L1Q676U5 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATG16L1Q676U5 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATG16L1Q676U5 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATG16L1Q676U5 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATG16L1Q676U5 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATG16L1Q676U5 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATG16L1Q676U5 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATG16L1Q676U5 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATG16L1Q676U5 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATG16L1Q676U5 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATG16L1Q676U5 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATG16L1Q676U5 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATG16L1Q676U5 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATG16L1Q676U5 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATG16L1Q676U5 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATG16L1Q676U5 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATG16L1Q676U5 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATG16L1Q676U5 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATG16L1Q676U5 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
ATG16L1Q676U5 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATG16L1Q676U5 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATG16L1Q676U5 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATG16L1Q676U5 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATG16L1Q676U5 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATG16L1Q676U5 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATG16L1Q676U5 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
ATG16L1Q676U5 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
ATG16L1Q676U5 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATG16L1Q676U5 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATG16L1Q676U5 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATG16L1Q676U5 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATG16L1Q676U5 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
ATG16L1Q676U5 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATG16L1Q676U5 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATG16L1Q676U5 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATG16L1Q676U5 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATG16L1Q676U5 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ATG16L1Q676U5 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms