Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV4

BRMS1L, Breast cancer metastasis-suppressor 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1LQ5PSV4 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms