Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
DUSP28Q4G0W2 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms