Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms