Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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