Protein–RNA interactions for Protein: Q16378

PRR4, Proline-rich protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR4Q16378 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PRR4Q16378 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PRR4Q16378 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
PRR4Q16378 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
PRR4Q16378 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
PRR4Q16378 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PRR4Q16378 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PRR4Q16378 TNS1-207ENST00000430930 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PRR4Q16378 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
PRR4Q16378 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
PRR4Q16378 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PRR4Q16378 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PRR4Q16378 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
PRR4Q16378 TNS1-205ENST00000419504 5921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PRR4Q16378 STARD8-203ENST00000374599 4841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PRR4Q16378 SEC23A-201ENST00000307712 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PRR4Q16378 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PRR4Q16378 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
PRR4Q16378 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
PRR4Q16378 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
PRR4Q16378 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
PRR4Q16378 CTBP1-AS-201ENST00000625256 3886 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PRR4Q16378 SLC24A4-204ENST00000531433 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
PRR4Q16378 MAGEL2-201ENST00000532292 4298 ntAPPRIS P1 BASIC9.28□□□□□ -0.92
PRR4Q16378 RSBN1L-201ENST00000334955 6422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PRR4Q16378 RGS12-202ENST00000338806 3010 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PRR4Q16378 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PRR4Q16378 PTCH1-207ENST00000429896 6563 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PRR4Q16378 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC9.28□□□□□ -0.92
PRR4Q16378 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
PRR4Q16378 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PRR4Q16378 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PRR4Q16378 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
PRR4Q16378 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC9.28□□□□□ -0.92
PRR4Q16378 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
PRR4Q16378 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
PRR4Q16378 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC9.28□□□□□ -0.92
PRR4Q16378 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
PRR4Q16378 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
PRR4Q16378 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PRR4Q16378 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
PRR4Q16378 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
PRR4Q16378 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
PRR4Q16378 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
PRR4Q16378 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
PRR4Q16378 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
PRR4Q16378 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PRR4Q16378 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
PRR4Q16378 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
PRR4Q16378 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC9.28□□□□□ -0.92
PRR4Q16378 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
PRR4Q16378 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PRR4Q16378 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PRR4Q16378 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
PRR4Q16378 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC9.28□□□□□ -0.92
PRR4Q16378 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
PRR4Q16378 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
PRR4Q16378 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
PRR4Q16378 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
PRR4Q16378 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
PRR4Q16378 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC9.28□□□□□ -0.92
PRR4Q16378 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
PRR4Q16378 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
PRR4Q16378 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
PRR4Q16378 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC9.28□□□□□ -0.92
PRR4Q16378 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC9.28□□□□□ -0.92
PRR4Q16378 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
PRR4Q16378 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
PRR4Q16378 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PRR4Q16378 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PRR4Q16378 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
PRR4Q16378 KCNMA1-227ENST00000638203 3840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
PRR4Q16378 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
PRR4Q16378 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
PRR4Q16378 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PRR4Q16378 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PRR4Q16378 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PRR4Q16378 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PRR4Q16378 NUDCD3-202ENST00000355451 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PRR4Q16378 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
PRR4Q16378 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
PRR4Q16378 HEXA-201ENST00000268097 5252 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PRR4Q16378 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
PRR4Q16378 PCDHGA5-201ENST00000518069 4602 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PRR4Q16378 UNC13D-201ENST00000207549 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PRR4Q16378 TDRD9-202ENST00000409874 4782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
PRR4Q16378 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PRR4Q16378 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
PRR4Q16378 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PRR4Q16378 SLC6A1-201ENST00000287766 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PRR4Q16378 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
PRR4Q16378 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
PRR4Q16378 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
PRR4Q16378 CAMTA2-204ENST00000414043 4589 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
PRR4Q16378 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
PRR4Q16378 COL3A1-201ENST00000304636 5543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
PRR4Q16378 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
PRR4Q16378 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
PRR4Q16378 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.92
PRR4Q16378 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms