Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
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