Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 AC010894.2-201ENST00000444196 561 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 AC008440.1-201ENST00000455835 439 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 LINC02507-201ENST00000509370 1028 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 AC006207.1-201ENST00000637958 562 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 CST9-201ENST00000376971 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 MRPL43-211ENST00000477279 903 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 NMRK2-202ENST00000593949 869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 NMRK2-204ENST00000599576 691 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 ANKRD20A21P-201ENST00000611282 517 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 CHD2-218ENST00000629346 1249 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 LINC01983-201ENST00000413586 574 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 FDPSP7-201ENST00000429043 1054 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 AC008972.2-201ENST00000606587 494 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 DAD1-201ENST00000250498 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 AC128689.1-202ENST00000459861 827 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 AC022274.1-201ENST00000467082 490 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 C1orf198-207ENST00000523410 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 ANO3-205ENST00000531646 1264 ntTSL 4 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms