Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SCN9AQ15858 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SCN9AQ15858 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SCN9AQ15858 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SCN9AQ15858 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SCN9AQ15858 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SCN9AQ15858 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SCN9AQ15858 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SCN9AQ15858 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SCN9AQ15858 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SCN9AQ15858 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SCN9AQ15858 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SCN9AQ15858 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SCN9AQ15858 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SCN9AQ15858 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
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SCN9AQ15858 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SCN9AQ15858 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
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SCN9AQ15858 AC011451.3-201ENST00000634951 582 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SCN9AQ15858 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SCN9AQ15858 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
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SCN9AQ15858 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SCN9AQ15858 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
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SCN9AQ15858 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCN9AQ15858 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
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SCN9AQ15858 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
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SCN9AQ15858 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCN9AQ15858 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCN9AQ15858 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCN9AQ15858 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
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SCN9AQ15858 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCN9AQ15858 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCN9AQ15858 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCN9AQ15858 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCN9AQ15858 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCN9AQ15858 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCN9AQ15858 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
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SCN9AQ15858 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCN9AQ15858 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCN9AQ15858 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCN9AQ15858 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCN9AQ15858 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCN9AQ15858 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCN9AQ15858 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCN9AQ15858 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
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