Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
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SIX1Q15475 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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SIX1Q15475 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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SIX1Q15475 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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SIX1Q15475 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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SIX1Q15475 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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SIX1Q15475 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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SIX1Q15475 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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SIX1Q15475 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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SIX1Q15475 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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