Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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