Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GAPVD1Q14C86 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GAPVD1Q14C86 AL135936.1-201ENST00000617956 998 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GAPVD1Q14C86 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GAPVD1Q14C86 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GAPVD1Q14C86 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GAPVD1Q14C86 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GAPVD1Q14C86 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GAPVD1Q14C86 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GAPVD1Q14C86 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GAPVD1Q14C86 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GAPVD1Q14C86 LCN6-201ENST00000341206 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GAPVD1Q14C86 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GAPVD1Q14C86 AL035413.1-201ENST00000437898 507 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GAPVD1Q14C86 AC128689.1-202ENST00000459861 827 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GAPVD1Q14C86 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GAPVD1Q14C86 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GAPVD1Q14C86 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GAPVD1Q14C86 RN7SL288P-201ENST00000490496 291 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
GAPVD1Q14C86 EVX1-AS-203ENST00000519218 554 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GAPVD1Q14C86 EHF-208ENST00000530286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GAPVD1Q14C86 SELENOW-212ENST00000601048 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GAPVD1Q14C86 COQ4-204ENST00000608951 781 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GAPVD1Q14C86 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GAPVD1Q14C86 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GAPVD1Q14C86 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GAPVD1Q14C86 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GAPVD1Q14C86 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GAPVD1Q14C86 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GAPVD1Q14C86 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GAPVD1Q14C86 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GAPVD1Q14C86 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GAPVD1Q14C86 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GAPVD1Q14C86 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GAPVD1Q14C86 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GAPVD1Q14C86 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GAPVD1Q14C86 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GAPVD1Q14C86 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GAPVD1Q14C86 OPN1SW-201ENST00000249389 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GAPVD1Q14C86 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
GAPVD1Q14C86 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GAPVD1Q14C86 AC111149.2-202ENST00000518355 599 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GAPVD1Q14C86 AC006547.3-201ENST00000600090 583 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GAPVD1Q14C86 IDH3A-224ENST00000629769 114 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GAPVD1Q14C86 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GAPVD1Q14C86 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GAPVD1Q14C86 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GAPVD1Q14C86 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GAPVD1Q14C86 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GAPVD1Q14C86 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GAPVD1Q14C86 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GAPVD1Q14C86 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GAPVD1Q14C86 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GAPVD1Q14C86 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GAPVD1Q14C86 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GAPVD1Q14C86 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GAPVD1Q14C86 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GAPVD1Q14C86 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GAPVD1Q14C86 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GAPVD1Q14C86 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GAPVD1Q14C86 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GAPVD1Q14C86 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GAPVD1Q14C86 PCK2-208ENST00000559250 1804 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GAPVD1Q14C86 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GAPVD1Q14C86 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GAPVD1Q14C86 COPS7B-204ENST00000409091 806 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GAPVD1Q14C86 LINC00483-202ENST00000419688 558 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GAPVD1Q14C86 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GAPVD1Q14C86 MUSTN1-202ENST00000486659 622 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GAPVD1Q14C86 ALG1L7P-201ENST00000502317 768 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GAPVD1Q14C86 AC087203.1-201ENST00000532111 1181 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GAPVD1Q14C86 EMC4-208ENST00000559078 599 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GAPVD1Q14C86 RN7SL556P-201ENST00000582856 298 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GAPVD1Q14C86 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GAPVD1Q14C86 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GAPVD1Q14C86 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GAPVD1Q14C86 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GAPVD1Q14C86 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GAPVD1Q14C86 ARRB2-218ENST00000575877 1579 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GAPVD1Q14C86 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GAPVD1Q14C86 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GAPVD1Q14C86 AL365181.1-201ENST00000564032 1828 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GAPVD1Q14C86 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GAPVD1Q14C86 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GAPVD1Q14C86 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GAPVD1Q14C86 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GAPVD1Q14C86 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GAPVD1Q14C86 IFNLR1-204ENST00000374419 953 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GAPVD1Q14C86 HIST1H4B-201ENST00000377745 438 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GAPVD1Q14C86 OR10N1P-201ENST00000392758 869 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GAPVD1Q14C86 AL121983.2-202ENST00000419983 535 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GAPVD1Q14C86 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GAPVD1Q14C86 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GAPVD1Q14C86 EEF1GP8-201ENST00000506566 1154 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GAPVD1Q14C86 AL590235.1-201ENST00000564650 861 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GAPVD1Q14C86 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GAPVD1Q14C86 HERPUD1-202ENST00000344114 1388 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GAPVD1Q14C86 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GAPVD1Q14C86 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GAPVD1Q14C86 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
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