Protein–RNA interactions for Protein: Q14574

DSC3, Desmocollin-3, humanhuman

Predictions only

Length 896 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC3Q14574 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms