Protein–RNA interactions for Protein: Q14164

IKBKE, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit epsilon, humanhuman

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Length 716 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKBKEQ14164 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
IKBKEQ14164 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IKBKEQ14164 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IKBKEQ14164 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IKBKEQ14164 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IKBKEQ14164 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IKBKEQ14164 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IKBKEQ14164 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IKBKEQ14164 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IKBKEQ14164 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IKBKEQ14164 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
IKBKEQ14164 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IKBKEQ14164 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IKBKEQ14164 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IKBKEQ14164 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IKBKEQ14164 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IKBKEQ14164 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IKBKEQ14164 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IKBKEQ14164 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IKBKEQ14164 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IKBKEQ14164 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IKBKEQ14164 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IKBKEQ14164 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IKBKEQ14164 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IKBKEQ14164 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IKBKEQ14164 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IKBKEQ14164 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IKBKEQ14164 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IKBKEQ14164 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IKBKEQ14164 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IKBKEQ14164 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IKBKEQ14164 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IKBKEQ14164 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IKBKEQ14164 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IKBKEQ14164 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IKBKEQ14164 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IKBKEQ14164 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IKBKEQ14164 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IKBKEQ14164 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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IKBKEQ14164 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IKBKEQ14164 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
IKBKEQ14164 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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IKBKEQ14164 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
IKBKEQ14164 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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IKBKEQ14164 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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IKBKEQ14164 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IKBKEQ14164 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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IKBKEQ14164 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IKBKEQ14164 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IKBKEQ14164 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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IKBKEQ14164 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IKBKEQ14164 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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IKBKEQ14164 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IKBKEQ14164 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IKBKEQ14164 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IKBKEQ14164 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IKBKEQ14164 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IKBKEQ14164 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IKBKEQ14164 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
IKBKEQ14164 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
IKBKEQ14164 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IKBKEQ14164 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IKBKEQ14164 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IKBKEQ14164 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IKBKEQ14164 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IKBKEQ14164 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IKBKEQ14164 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IKBKEQ14164 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IKBKEQ14164 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IKBKEQ14164 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IKBKEQ14164 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IKBKEQ14164 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IKBKEQ14164 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IKBKEQ14164 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IKBKEQ14164 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IKBKEQ14164 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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