Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTAN1Q13813 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTAN1Q13813 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTAN1Q13813 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTAN1Q13813 STAG1-206ENST00000480733 1304 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTAN1Q13813 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTAN1Q13813 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTAN1Q13813 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTAN1Q13813 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTAN1Q13813 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTAN1Q13813 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTAN1Q13813 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTAN1Q13813 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTAN1Q13813 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTAN1Q13813 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTAN1Q13813 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTAN1Q13813 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTAN1Q13813 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTAN1Q13813 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTAN1Q13813 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTAN1Q13813 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTAN1Q13813 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTAN1Q13813 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTAN1Q13813 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTAN1Q13813 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTAN1Q13813 TRAPPC2L-212ENST00000567312 499 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTAN1Q13813 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTAN1Q13813 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTAN1Q13813 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTAN1Q13813 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTAN1Q13813 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTAN1Q13813 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTAN1Q13813 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTAN1Q13813 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTAN1Q13813 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTAN1Q13813 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTAN1Q13813 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTAN1Q13813 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTAN1Q13813 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTAN1Q13813 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SPTAN1Q13813 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPTAN1Q13813 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPTAN1Q13813 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPTAN1Q13813 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SPTAN1Q13813 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPTAN1Q13813 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SPTAN1Q13813 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SPTAN1Q13813 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SPTAN1Q13813 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPTAN1Q13813 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPTAN1Q13813 NHP2P1-201ENST00000335274 462 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SPTAN1Q13813 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SPTAN1Q13813 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SPTAN1Q13813 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
SPTAN1Q13813 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
SPTAN1Q13813 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SPTAN1Q13813 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
SPTAN1Q13813 AC254633.1-201ENST00000606790 345 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SPTAN1Q13813 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SPTAN1Q13813 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SPTAN1Q13813 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPTAN1Q13813 NUB1-212ENST00000568733 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPTAN1Q13813 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SPTAN1Q13813 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SPTAN1Q13813 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPTAN1Q13813 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPTAN1Q13813 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SPTAN1Q13813 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPTAN1Q13813 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPTAN1Q13813 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPTAN1Q13813 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPTAN1Q13813 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SPTAN1Q13813 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SPTAN1Q13813 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SPTAN1Q13813 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPTAN1Q13813 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPTAN1Q13813 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SPTAN1Q13813 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SPTAN1Q13813 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SPTAN1Q13813 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPTAN1Q13813 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SPTAN1Q13813 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPTAN1Q13813 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPTAN1Q13813 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPTAN1Q13813 HIST1H2BJ-201ENST00000339812 381 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
SPTAN1Q13813 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPTAN1Q13813 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
SPTAN1Q13813 AC114812.1-201ENST00000421868 689 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SPTAN1Q13813 JAZF1-AS1-201ENST00000436758 548 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SPTAN1Q13813 RNLS-203ENST00000437752 525 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SPTAN1Q13813 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPTAN1Q13813 GDNF-207ENST00000515058 764 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SPTAN1Q13813 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SPTAN1Q13813 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
SPTAN1Q13813 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPTAN1Q13813 PSME2-217ENST00000615264 874 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SPTAN1Q13813 AC015912.3-201ENST00000619432 348 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SPTAN1Q13813 PSME2-218ENST00000630027 185 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
SPTAN1Q13813 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
SPTAN1Q13813 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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