Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

Predictions only

Length 2,644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ATRQ13535 PGAM1P11-201ENST00000416729 680 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
ATRQ13535 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ATRQ13535 AC006328.1-201ENST00000437571 379 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
ATRQ13535 GH2-203ENST00000449787 753 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ATRQ13535 AC111149.2-202ENST00000518355 599 ntTSL 4 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ATRQ13535 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ATRQ13535 CSTP2-201ENST00000610599 398 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
ATRQ13535 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ATRQ13535 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ATRQ13535 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ATRQ13535 PPHLN1-223ENST00000610488 1521 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ATRQ13535 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ATRQ13535 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ATRQ13535 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ATRQ13535 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ATRQ13535 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ATRQ13535 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ATRQ13535 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ATRQ13535 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ATRQ13535 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ATRQ13535 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ATRQ13535 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ATRQ13535 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ATRQ13535 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
ATRQ13535 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ATRQ13535 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ATRQ13535 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ATRQ13535 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ATRQ13535 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ATRQ13535 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ATRQ13535 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ATRQ13535 TNNT1-202ENST00000356783 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ATRQ13535 PRR23A-201ENST00000383163 801 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ATRQ13535 IGHV5-51-201ENST00000390626 410 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ATRQ13535 KRT18P4-201ENST00000422599 1288 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
ATRQ13535 AL773545.2-201ENST00000442149 472 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
ATRQ13535 CDK4P1-201ENST00000454213 828 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
ATRQ13535 LINC00892-203ENST00000454385 686 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ATRQ13535 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ATRQ13535 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ATRQ13535 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ATRQ13535 AC020922.4-201ENST00000621389 339 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
ATRQ13535 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ATRQ13535 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ATRQ13535 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ATRQ13535 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ATRQ13535 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ATRQ13535 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ATRQ13535 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ATRQ13535 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ATRQ13535 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ATRQ13535 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ATRQ13535 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ATRQ13535 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ATRQ13535 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
ATRQ13535 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ATRQ13535 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ATRQ13535 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ATRQ13535 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ATRQ13535 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ATRQ13535 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ATRQ13535 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ATRQ13535 TRPC7-AS1-201ENST00000514459 460 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ATRQ13535 IGHEP2-201ENST00000519308 1256 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
ATRQ13535 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ATRQ13535 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ATRQ13535 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ATRQ13535 AC023968.2-201ENST00000560593 1049 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
ATRQ13535 AL353658.2-201ENST00000629794 519 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ATRQ13535 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ATRQ13535 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ATRQ13535 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ATRQ13535 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ATRQ13535 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ATRQ13535 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ATRQ13535 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
ATRQ13535 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ATRQ13535 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ATRQ13535 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ATRQ13535 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ATRQ13535 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ATRQ13535 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ATRQ13535 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ATRQ13535 NECTIN1-203ENST00000341398 1377 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ATRQ13535 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ATRQ13535 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ATRQ13535 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ATRQ13535 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ATRQ13535 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ATRQ13535 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ATRQ13535 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ATRQ13535 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ATRQ13535 PIFO-201ENST00000369737 746 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ATRQ13535 RN7SL147P-201ENST00000487345 298 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
ATRQ13535 TMA16-204ENST00000508268 608 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ATRQ13535 UBR5-AS1-202ENST00000520820 800 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ATRQ13535 MT1G-203ENST00000568675 628 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ATRQ13535 BIRC5-211ENST00000592734 386 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ATRQ13535 NEK4P3-201ENST00000604859 544 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms