Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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PTP4A2Q12974 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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PTP4A2Q12974 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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PTP4A2Q12974 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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PTP4A2Q12974 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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PTP4A2Q12974 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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PTP4A2Q12974 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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