Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

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Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 ATF4-203ENST00000404241 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 CRHR1-205ENST00000352855 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 KCNE1-203ENST00000399286 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 RPL3P5-201ENST00000441645 1232 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 AL451000.1-201ENST00000451300 1186 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 BPIFB5P-201ENST00000457066 1099 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 AL928742.1-201ENST00000497397 548 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 FTLP5-201ENST00000586853 534 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 DHRS7-209ENST00000557185 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 SUMO4-201ENST00000326669 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 PTGER4P2-201ENST00000328411 252 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 KCNK18-201ENST00000334549 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 ZNF614-202ENST00000356322 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 PTGER4P3-201ENST00000458150 252 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 EFHD1-207ENST00000611312 1490 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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