Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms