Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LTBQ06643 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LTBQ06643 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LTBQ06643 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LTBQ06643 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LTBQ06643 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LTBQ06643 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LTBQ06643 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LTBQ06643 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LTBQ06643 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LTBQ06643 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LTBQ06643 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LTBQ06643 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
LTBQ06643 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LTBQ06643 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
LTBQ06643 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LTBQ06643 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LTBQ06643 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LTBQ06643 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LTBQ06643 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LTBQ06643 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
LTBQ06643 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LTBQ06643 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LTBQ06643 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LTBQ06643 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LTBQ06643 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
LTBQ06643 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LTBQ06643 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LTBQ06643 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LTBQ06643 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LTBQ06643 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LTBQ06643 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LTBQ06643 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LTBQ06643 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LTBQ06643 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LTBQ06643 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LTBQ06643 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LTBQ06643 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LTBQ06643 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LTBQ06643 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LTBQ06643 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
LTBQ06643 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LTBQ06643 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LTBQ06643 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LTBQ06643 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LTBQ06643 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LTBQ06643 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LTBQ06643 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LTBQ06643 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LTBQ06643 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LTBQ06643 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LTBQ06643 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LTBQ06643 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
LTBQ06643 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LTBQ06643 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LTBQ06643 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LTBQ06643 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LTBQ06643 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LTBQ06643 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LTBQ06643 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LTBQ06643 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
LTBQ06643 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LTBQ06643 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LTBQ06643 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LTBQ06643 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LTBQ06643 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LTBQ06643 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
LTBQ06643 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LTBQ06643 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LTBQ06643 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LTBQ06643 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LTBQ06643 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LTBQ06643 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LTBQ06643 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LTBQ06643 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LTBQ06643 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LTBQ06643 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LTBQ06643 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LTBQ06643 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LTBQ06643 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LTBQ06643 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LTBQ06643 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LTBQ06643 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
LTBQ06643 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LTBQ06643 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
LTBQ06643 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LTBQ06643 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LTBQ06643 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LTBQ06643 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LTBQ06643 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LTBQ06643 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LTBQ06643 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LTBQ06643 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LTBQ06643 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LTBQ06643 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LTBQ06643 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LTBQ06643 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LTBQ06643 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LTBQ06643 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LTBQ06643 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms