Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms