Protein–RNA interactions for Protein: P60608

ERVFC1-1, Endogenous retrovirus group FC1 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1-1P60608 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 RIOK3-203ENST00000577501 1904 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 NCLN-201ENST00000246117 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 CHL1-201ENST00000256509 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 DLX1-201ENST00000341900 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 AC134407.3-201ENST00000624035 2139 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 AOC1-204ENST00000467291 2857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 OFD1-201ENST00000340096 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 CACNA1G-222ENST00000510366 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 CACNA1G-227ENST00000513964 6735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 CIPC-201ENST00000361786 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 GDPD5-209ENST00000529721 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 SYK-203ENST00000375751 4936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 HNRNPH1-202ENST00000356731 3667 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 COL18A1-AS1-201ENST00000397787 3425 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 HYOU1-220ENST00000617285 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 SPOUT1-201ENST00000361256 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 SRPRB-201ENST00000466490 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 RTL10-202ENST00000405640 6785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 TP53INP2-202ENST00000374810 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 DLGAP1-203ENST00000400147 5258 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 DLGAP1-206ENST00000400155 5257 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 ALKBH5-201ENST00000399138 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 RERE-201ENST00000337907 8026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 RGMA-203ENST00000542321 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 LINC01749-202ENST00000607802 3408 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 SMARCA4-205ENST00000450717 5506 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 FAM189A2-204ENST00000455972 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ERVFC1-1P60608 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.3 ms