Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms