Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.3 ms