Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
DAP3P51398 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
DAP3P51398 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
DAP3P51398 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
DAP3P51398 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
DAP3P51398 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
DAP3P51398 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
DAP3P51398 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
DAP3P51398 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
DAP3P51398 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
DAP3P51398 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
DAP3P51398 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DAP3P51398 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
DAP3P51398 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DAP3P51398 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DAP3P51398 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
DAP3P51398 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DAP3P51398 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
DAP3P51398 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
DAP3P51398 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
DAP3P51398 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
DAP3P51398 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DAP3P51398 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
DAP3P51398 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DAP3P51398 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
DAP3P51398 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
DAP3P51398 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DAP3P51398 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DAP3P51398 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DAP3P51398 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DAP3P51398 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
DAP3P51398 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DAP3P51398 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
DAP3P51398 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DAP3P51398 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
DAP3P51398 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
DAP3P51398 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
DAP3P51398 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
DAP3P51398 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
DAP3P51398 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
DAP3P51398 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
DAP3P51398 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
DAP3P51398 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DAP3P51398 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DAP3P51398 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DAP3P51398 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DAP3P51398 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DAP3P51398 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DAP3P51398 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
DAP3P51398 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
DAP3P51398 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DAP3P51398 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DAP3P51398 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DAP3P51398 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DAP3P51398 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
DAP3P51398 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
DAP3P51398 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
DAP3P51398 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DAP3P51398 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DAP3P51398 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
DAP3P51398 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DAP3P51398 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
DAP3P51398 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DAP3P51398 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
DAP3P51398 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
DAP3P51398 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
DAP3P51398 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DAP3P51398 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DAP3P51398 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DAP3P51398 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DAP3P51398 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
DAP3P51398 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DAP3P51398 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DAP3P51398 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
DAP3P51398 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
DAP3P51398 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DAP3P51398 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
DAP3P51398 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DAP3P51398 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DAP3P51398 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
DAP3P51398 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DAP3P51398 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
DAP3P51398 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
DAP3P51398 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
DAP3P51398 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
DAP3P51398 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
DAP3P51398 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
DAP3P51398 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
DAP3P51398 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DAP3P51398 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
DAP3P51398 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
DAP3P51398 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DAP3P51398 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DAP3P51398 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
DAP3P51398 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DAP3P51398 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DAP3P51398 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DAP3P51398 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DAP3P51398 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
DAP3P51398 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms