Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GCLMP48507 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GCLMP48507 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GCLMP48507 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GCLMP48507 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GCLMP48507 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GCLMP48507 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GCLMP48507 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GCLMP48507 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GCLMP48507 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GCLMP48507 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GCLMP48507 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GCLMP48507 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GCLMP48507 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GCLMP48507 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GCLMP48507 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GCLMP48507 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GCLMP48507 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GCLMP48507 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GCLMP48507 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GCLMP48507 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GCLMP48507 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GCLMP48507 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GCLMP48507 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GCLMP48507 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GCLMP48507 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GCLMP48507 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GCLMP48507 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GCLMP48507 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
GCLMP48507 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.18
GCLMP48507 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
GCLMP48507 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
GCLMP48507 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
GCLMP48507 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCLMP48507 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCLMP48507 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCLMP48507 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCLMP48507 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCLMP48507 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCLMP48507 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCLMP48507 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCLMP48507 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCLMP48507 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCLMP48507 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCLMP48507 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCLMP48507 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCLMP48507 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCLMP48507 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCLMP48507 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCLMP48507 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCLMP48507 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCLMP48507 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCLMP48507 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCLMP48507 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCLMP48507 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCLMP48507 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCLMP48507 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCLMP48507 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCLMP48507 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCLMP48507 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCLMP48507 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCLMP48507 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCLMP48507 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GCLMP48507 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCLMP48507 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCLMP48507 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GCLMP48507 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCLMP48507 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCLMP48507 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCLMP48507 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCLMP48507 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCLMP48507 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCLMP48507 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCLMP48507 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCLMP48507 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCLMP48507 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GCLMP48507 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCLMP48507 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCLMP48507 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCLMP48507 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCLMP48507 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCLMP48507 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCLMP48507 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCLMP48507 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCLMP48507 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCLMP48507 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GCLMP48507 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCLMP48507 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCLMP48507 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCLMP48507 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCLMP48507 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCLMP48507 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCLMP48507 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCLMP48507 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCLMP48507 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCLMP48507 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GCLMP48507 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCLMP48507 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCLMP48507 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GCLMP48507 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms