Protein–RNA interactions for Protein: P48230

TM4SF4, Transmembrane 4 L6 family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF4P48230 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 CR382285.1-201ENST00000625012 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 GEMIN8P4-201ENST00000380526 729 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 TEX33-201ENST00000381821 978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 AC103702.2-203ENST00000425510 379 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 AL512599.1-201ENST00000430724 685 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 DLK1-205ENST00000556051 469 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 HNRNPA1P5-201ENST00000558213 966 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 PHF23-213ENST00000613632 850 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 CTSH-218ENST00000615999 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 ANKRD36C-208ENST00000619511 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 OXSM-201ENST00000280701 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 JPT1-202ENST00000356033 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 KLK4-201ENST00000324041 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 FDFT1-214ENST00000528812 2013 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 F10-201ENST00000375551 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 PPHLN1-223ENST00000610488 1521 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 PLA2G2A-202ENST00000400520 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 LINC00483-202ENST00000419688 558 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 CDK2-203ENST00000440311 1031 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 FOXP4-AS1-205ENST00000454812 575 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 SMAD7-208ENST00000591805 1152 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 ZNF737-204ENST00000596797 569 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 AL645608.7-201ENST00000607769 351 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 VDAC2-202ENST00000313132 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TM4SF4P48230 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TM4SF4P48230 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TM4SF4P48230 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TM4SF4P48230 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TM4SF4P48230 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TM4SF4P48230 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TM4SF4P48230 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TM4SF4P48230 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TM4SF4P48230 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TM4SF4P48230 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TM4SF4P48230 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TM4SF4P48230 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TM4SF4P48230 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TM4SF4P48230 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TM4SF4P48230 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TM4SF4P48230 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TM4SF4P48230 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TM4SF4P48230 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TM4SF4P48230 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TM4SF4P48230 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TM4SF4P48230 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms