Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ME1P48163 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ME1P48163 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ME1P48163 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ME1P48163 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ME1P48163 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ME1P48163 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ME1P48163 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ME1P48163 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ME1P48163 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ME1P48163 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ME1P48163 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ME1P48163 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ME1P48163 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ME1P48163 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ME1P48163 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ME1P48163 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ME1P48163 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ME1P48163 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ME1P48163 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ME1P48163 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ME1P48163 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ME1P48163 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ME1P48163 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ME1P48163 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ME1P48163 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ME1P48163 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ME1P48163 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ME1P48163 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ME1P48163 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ME1P48163 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ME1P48163 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ME1P48163 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ME1P48163 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ME1P48163 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ME1P48163 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ME1P48163 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ME1P48163 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ME1P48163 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ME1P48163 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ME1P48163 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ME1P48163 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ME1P48163 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ME1P48163 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ME1P48163 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ME1P48163 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ME1P48163 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ME1P48163 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ME1P48163 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ME1P48163 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ME1P48163 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ME1P48163 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ME1P48163 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ME1P48163 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ME1P48163 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ME1P48163 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ME1P48163 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ME1P48163 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ME1P48163 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ME1P48163 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ME1P48163 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ME1P48163 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ME1P48163 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ME1P48163 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ME1P48163 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ME1P48163 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ME1P48163 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ME1P48163 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ME1P48163 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ME1P48163 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ME1P48163 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ME1P48163 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ME1P48163 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ME1P48163 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ME1P48163 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ME1P48163 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ME1P48163 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ME1P48163 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ME1P48163 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ME1P48163 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ME1P48163 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ME1P48163 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ME1P48163 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ME1P48163 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ME1P48163 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ME1P48163 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ME1P48163 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ME1P48163 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ME1P48163 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ME1P48163 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ME1P48163 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ME1P48163 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ME1P48163 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ME1P48163 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ME1P48163 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ME1P48163 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ME1P48163 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ME1P48163 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ME1P48163 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ME1P48163 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms