Protein–RNA interactions for Protein: P46736

BRCC3, Lys-63-specific deubiquitinase BRCC36, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCC3P46736 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
BRCC3P46736 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms