Protein–RNA interactions for Protein: P43307

SSR1, Translocon-associated protein subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR1P43307 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSR1P43307 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSR1P43307 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSR1P43307 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SSR1P43307 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSR1P43307 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSR1P43307 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SSR1P43307 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSR1P43307 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSR1P43307 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSR1P43307 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSR1P43307 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSR1P43307 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSR1P43307 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSR1P43307 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSR1P43307 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSR1P43307 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SSR1P43307 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSR1P43307 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSR1P43307 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSR1P43307 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSR1P43307 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSR1P43307 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSR1P43307 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSR1P43307 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSR1P43307 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSR1P43307 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSR1P43307 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSR1P43307 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSR1P43307 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSR1P43307 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSR1P43307 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSR1P43307 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SSR1P43307 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSR1P43307 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSR1P43307 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSR1P43307 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SSR1P43307 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSR1P43307 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSR1P43307 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSR1P43307 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SSR1P43307 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSR1P43307 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSR1P43307 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SSR1P43307 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSR1P43307 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SSR1P43307 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSR1P43307 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSR1P43307 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSR1P43307 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SSR1P43307 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSR1P43307 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSR1P43307 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSR1P43307 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SSR1P43307 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSR1P43307 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSR1P43307 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSR1P43307 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSR1P43307 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSR1P43307 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSR1P43307 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSR1P43307 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSR1P43307 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSR1P43307 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSR1P43307 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSR1P43307 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSR1P43307 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSR1P43307 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSR1P43307 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSR1P43307 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSR1P43307 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSR1P43307 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSR1P43307 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSR1P43307 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSR1P43307 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSR1P43307 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSR1P43307 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSR1P43307 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSR1P43307 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSR1P43307 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSR1P43307 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSR1P43307 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSR1P43307 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSR1P43307 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSR1P43307 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSR1P43307 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSR1P43307 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSR1P43307 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SSR1P43307 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSR1P43307 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSR1P43307 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSR1P43307 MDM1-203ENST00000393543 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSR1P43307 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSR1P43307 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSR1P43307 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSR1P43307 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSR1P43307 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSR1P43307 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSR1P43307 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SSR1P43307 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms