Protein–RNA interactions for Protein: P42830

CXCL5, C-X-C motif chemokine 5, humanhuman

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL5P42830 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 GPC4-201ENST00000370828 4960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 SLC44A1-202ENST00000374723 9640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 CEP126-201ENST00000263468 7039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 MYNN-201ENST00000349841 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 SPDYE16-203ENST00000633306 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 TBX3-202ENST00000349155 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 ADGRD1-201ENST00000261654 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 IL21R-204ENST00000564089 3009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 SLC4A1-201ENST00000262418 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 GOLGA3-201ENST00000204726 9252 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 ITGB2-201ENST00000302347 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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CXCL5P42830 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 TLL2-201ENST00000357947 6756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 AJAP1-202ENST00000378191 11666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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