Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GJC1P36383 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GJC1P36383 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GJC1P36383 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GJC1P36383 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GJC1P36383 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GJC1P36383 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GJC1P36383 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GJC1P36383 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GJC1P36383 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GJC1P36383 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GJC1P36383 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GJC1P36383 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GJC1P36383 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GJC1P36383 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GJC1P36383 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GJC1P36383 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GJC1P36383 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GJC1P36383 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GJC1P36383 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
GJC1P36383 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GJC1P36383 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GJC1P36383 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GJC1P36383 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
GJC1P36383 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GJC1P36383 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GJC1P36383 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GJC1P36383 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GJC1P36383 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GJC1P36383 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GJC1P36383 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GJC1P36383 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GJC1P36383 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GJC1P36383 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GJC1P36383 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GJC1P36383 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GJC1P36383 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GJC1P36383 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GJC1P36383 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GJC1P36383 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GJC1P36383 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GJC1P36383 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GJC1P36383 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
GJC1P36383 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GJC1P36383 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GJC1P36383 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GJC1P36383 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GJC1P36383 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
GJC1P36383 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
GJC1P36383 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
GJC1P36383 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GJC1P36383 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
GJC1P36383 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
GJC1P36383 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GJC1P36383 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GJC1P36383 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GJC1P36383 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GJC1P36383 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GJC1P36383 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GJC1P36383 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GJC1P36383 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GJC1P36383 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GJC1P36383 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GJC1P36383 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GJC1P36383 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GJC1P36383 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GJC1P36383 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GJC1P36383 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GJC1P36383 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GJC1P36383 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GJC1P36383 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GJC1P36383 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GJC1P36383 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GJC1P36383 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GJC1P36383 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GJC1P36383 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GJC1P36383 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GJC1P36383 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GJC1P36383 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GJC1P36383 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GJC1P36383 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GJC1P36383 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GJC1P36383 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GJC1P36383 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GJC1P36383 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GJC1P36383 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GJC1P36383 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GJC1P36383 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GJC1P36383 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GJC1P36383 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GJC1P36383 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GJC1P36383 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GJC1P36383 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GJC1P36383 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GJC1P36383 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GJC1P36383 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GJC1P36383 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GJC1P36383 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GJC1P36383 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GJC1P36383 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms