Protein–RNA interactions for Protein: P35527

KRT9, Keratin, type I cytoskeletal 9, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT9P35527 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT9P35527 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT9P35527 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT9P35527 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT9P35527 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT9P35527 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT9P35527 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT9P35527 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT9P35527 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT9P35527 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT9P35527 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT9P35527 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT9P35527 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT9P35527 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT9P35527 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT9P35527 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT9P35527 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT9P35527 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT9P35527 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT9P35527 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT9P35527 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT9P35527 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT9P35527 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT9P35527 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT9P35527 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT9P35527 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT9P35527 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT9P35527 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT9P35527 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT9P35527 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT9P35527 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT9P35527 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT9P35527 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT9P35527 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT9P35527 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT9P35527 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT9P35527 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT9P35527 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT9P35527 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT9P35527 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT9P35527 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT9P35527 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT9P35527 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT9P35527 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT9P35527 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT9P35527 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT9P35527 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT9P35527 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT9P35527 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT9P35527 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT9P35527 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT9P35527 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT9P35527 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT9P35527 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT9P35527 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT9P35527 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT9P35527 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT9P35527 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT9P35527 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT9P35527 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT9P35527 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT9P35527 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT9P35527 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT9P35527 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT9P35527 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT9P35527 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT9P35527 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT9P35527 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT9P35527 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT9P35527 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT9P35527 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT9P35527 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT9P35527 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT9P35527 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT9P35527 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT9P35527 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT9P35527 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT9P35527 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT9P35527 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT9P35527 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT9P35527 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT9P35527 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT9P35527 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT9P35527 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT9P35527 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT9P35527 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT9P35527 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT9P35527 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT9P35527 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT9P35527 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT9P35527 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT9P35527 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT9P35527 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT9P35527 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT9P35527 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT9P35527 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT9P35527 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT9P35527 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT9P35527 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT9P35527 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms