Protein–RNA interactions for Protein: P32297

CHRNA3, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA3P32297 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNA3P32297 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNA3P32297 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNA3P32297 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNA3P32297 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNA3P32297 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNA3P32297 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNA3P32297 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNA3P32297 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNA3P32297 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNA3P32297 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNA3P32297 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNA3P32297 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNA3P32297 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNA3P32297 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNA3P32297 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNA3P32297 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNA3P32297 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNA3P32297 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNA3P32297 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNA3P32297 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNA3P32297 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNA3P32297 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNA3P32297 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms