Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASQ1P31415 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASQ1P31415 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASQ1P31415 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASQ1P31415 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASQ1P31415 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASQ1P31415 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CASQ1P31415 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASQ1P31415 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASQ1P31415 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASQ1P31415 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASQ1P31415 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASQ1P31415 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASQ1P31415 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASQ1P31415 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASQ1P31415 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASQ1P31415 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASQ1P31415 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASQ1P31415 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASQ1P31415 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASQ1P31415 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASQ1P31415 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASQ1P31415 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASQ1P31415 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASQ1P31415 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASQ1P31415 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASQ1P31415 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASQ1P31415 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASQ1P31415 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASQ1P31415 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASQ1P31415 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CASQ1P31415 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASQ1P31415 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASQ1P31415 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CASQ1P31415 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
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CASQ1P31415 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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CASQ1P31415 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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CASQ1P31415 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASQ1P31415 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASQ1P31415 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASQ1P31415 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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CASQ1P31415 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASQ1P31415 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASQ1P31415 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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CASQ1P31415 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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CASQ1P31415 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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CASQ1P31415 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASQ1P31415 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASQ1P31415 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASQ1P31415 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASQ1P31415 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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CASQ1P31415 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASQ1P31415 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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CASQ1P31415 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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CASQ1P31415 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CASQ1P31415 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASQ1P31415 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASQ1P31415 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASQ1P31415 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CASQ1P31415 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASQ1P31415 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CASQ1P31415 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CASQ1P31415 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CASQ1P31415 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASQ1P31415 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASQ1P31415 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CASQ1P31415 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASQ1P31415 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASQ1P31415 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASQ1P31415 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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