Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSFA2P28290 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSFA2P28290 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SSFA2P28290 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSFA2P28290 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSFA2P28290 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SSFA2P28290 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SSFA2P28290 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSFA2P28290 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSFA2P28290 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSFA2P28290 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSFA2P28290 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSFA2P28290 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSFA2P28290 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSFA2P28290 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSFA2P28290 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSFA2P28290 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSFA2P28290 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSFA2P28290 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSFA2P28290 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSFA2P28290 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSFA2P28290 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSFA2P28290 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SSFA2P28290 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSFA2P28290 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SSFA2P28290 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSFA2P28290 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSFA2P28290 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SSFA2P28290 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSFA2P28290 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSFA2P28290 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SSFA2P28290 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSFA2P28290 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSFA2P28290 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSFA2P28290 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSFA2P28290 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSFA2P28290 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSFA2P28290 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSFA2P28290 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSFA2P28290 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSFA2P28290 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSFA2P28290 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSFA2P28290 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSFA2P28290 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSFA2P28290 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSFA2P28290 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSFA2P28290 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSFA2P28290 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSFA2P28290 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSFA2P28290 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SSFA2P28290 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSFA2P28290 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSFA2P28290 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSFA2P28290 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSFA2P28290 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSFA2P28290 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSFA2P28290 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SSFA2P28290 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSFA2P28290 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSFA2P28290 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSFA2P28290 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSFA2P28290 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SSFA2P28290 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSFA2P28290 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSFA2P28290 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSFA2P28290 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SSFA2P28290 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SSFA2P28290 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSFA2P28290 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSFA2P28290 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSFA2P28290 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSFA2P28290 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSFA2P28290 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSFA2P28290 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSFA2P28290 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSFA2P28290 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SSFA2P28290 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SSFA2P28290 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SSFA2P28290 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SSFA2P28290 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SSFA2P28290 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SSFA2P28290 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SSFA2P28290 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SSFA2P28290 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SSFA2P28290 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SSFA2P28290 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SSFA2P28290 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SSFA2P28290 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SSFA2P28290 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
SSFA2P28290 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SSFA2P28290 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SSFA2P28290 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
SSFA2P28290 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SSFA2P28290 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SSFA2P28290 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SSFA2P28290 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SSFA2P28290 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SSFA2P28290 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SSFA2P28290 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms