Protein–RNA interactions for Protein: P15976

GATA1, Erythroid transcription factor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA1P15976 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
GATA1P15976 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
GATA1P15976 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
GATA1P15976 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
GATA1P15976 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
GATA1P15976 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
GATA1P15976 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
GATA1P15976 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
GATA1P15976 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
GATA1P15976 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
GATA1P15976 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
GATA1P15976 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
GATA1P15976 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GATA1P15976 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GATA1P15976 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GATA1P15976 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GATA1P15976 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
GATA1P15976 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GATA1P15976 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
GATA1P15976 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
GATA1P15976 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
GATA1P15976 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GATA1P15976 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GATA1P15976 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GATA1P15976 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GATA1P15976 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GATA1P15976 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GATA1P15976 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GATA1P15976 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GATA1P15976 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GATA1P15976 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GATA1P15976 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
GATA1P15976 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GATA1P15976 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
GATA1P15976 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
GATA1P15976 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
GATA1P15976 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
GATA1P15976 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GATA1P15976 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
GATA1P15976 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
GATA1P15976 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
GATA1P15976 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
GATA1P15976 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
GATA1P15976 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
GATA1P15976 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
GATA1P15976 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GATA1P15976 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GATA1P15976 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
GATA1P15976 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC11.04□□□□□ -0.64
GATA1P15976 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
GATA1P15976 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.04□□□□□ -0.64
GATA1P15976 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
GATA1P15976 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
GATA1P15976 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GATA1P15976 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
GATA1P15976 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GATA1P15976 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GATA1P15976 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GATA1P15976 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
GATA1P15976 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GATA1P15976 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
GATA1P15976 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
GATA1P15976 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GATA1P15976 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
GATA1P15976 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GATA1P15976 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
GATA1P15976 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GATA1P15976 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GATA1P15976 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GATA1P15976 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
GATA1P15976 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GATA1P15976 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
GATA1P15976 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GATA1P15976 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GATA1P15976 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
GATA1P15976 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GATA1P15976 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
GATA1P15976 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GATA1P15976 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GATA1P15976 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GATA1P15976 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
GATA1P15976 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
GATA1P15976 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
GATA1P15976 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
GATA1P15976 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
GATA1P15976 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
GATA1P15976 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
GATA1P15976 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
GATA1P15976 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
GATA1P15976 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
GATA1P15976 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
GATA1P15976 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
GATA1P15976 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
GATA1P15976 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
GATA1P15976 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
GATA1P15976 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
GATA1P15976 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
GATA1P15976 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
GATA1P15976 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
GATA1P15976 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms