Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNB1P11230 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNB1P11230 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNB1P11230 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNB1P11230 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNB1P11230 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNB1P11230 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNB1P11230 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNB1P11230 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNB1P11230 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNB1P11230 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNB1P11230 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CHRNB1P11230 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNB1P11230 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNB1P11230 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNB1P11230 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNB1P11230 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNB1P11230 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNB1P11230 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNB1P11230 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNB1P11230 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNB1P11230 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CHRNB1P11230 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNB1P11230 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNB1P11230 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNB1P11230 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNB1P11230 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNB1P11230 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNB1P11230 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNB1P11230 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNB1P11230 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNB1P11230 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNB1P11230 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNB1P11230 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNB1P11230 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms