Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SKAP2O75563 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SKAP2O75563 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SKAP2O75563 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SKAP2O75563 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SKAP2O75563 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SKAP2O75563 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SKAP2O75563 GNG12-AS1-201ENST00000413628 2058 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SKAP2O75563 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SKAP2O75563 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SKAP2O75563 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SKAP2O75563 PCDHB10-201ENST00000239446 3290 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SKAP2O75563 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SKAP2O75563 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SKAP2O75563 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SKAP2O75563 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SKAP2O75563 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SKAP2O75563 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SKAP2O75563 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SKAP2O75563 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SKAP2O75563 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SKAP2O75563 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SKAP2O75563 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SKAP2O75563 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SKAP2O75563 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SKAP2O75563 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SKAP2O75563 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SKAP2O75563 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SKAP2O75563 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SKAP2O75563 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SKAP2O75563 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SKAP2O75563 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SKAP2O75563 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SKAP2O75563 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SKAP2O75563 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SKAP2O75563 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SKAP2O75563 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SKAP2O75563 GTF2IRD1P1-202ENST00000457166 2426 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SKAP2O75563 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SKAP2O75563 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SKAP2O75563 CPEB4-208ENST00000520867 2607 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SKAP2O75563 AC011700.1-201ENST00000610409 2627 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SKAP2O75563 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SKAP2O75563 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SKAP2O75563 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SKAP2O75563 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SKAP2O75563 CCDC117-201ENST00000249064 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SKAP2O75563 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SKAP2O75563 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SKAP2O75563 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SKAP2O75563 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SKAP2O75563 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SKAP2O75563 VSTM2A-201ENST00000302287 3401 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SKAP2O75563 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SKAP2O75563 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SKAP2O75563 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SKAP2O75563 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SKAP2O75563 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SKAP2O75563 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SKAP2O75563 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SKAP2O75563 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SKAP2O75563 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SKAP2O75563 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SKAP2O75563 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SKAP2O75563 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SKAP2O75563 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SKAP2O75563 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SKAP2O75563 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SKAP2O75563 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SKAP2O75563 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SKAP2O75563 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SKAP2O75563 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SKAP2O75563 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SKAP2O75563 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SKAP2O75563 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SKAP2O75563 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SKAP2O75563 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SKAP2O75563 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SKAP2O75563 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SKAP2O75563 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SKAP2O75563 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SKAP2O75563 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SKAP2O75563 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SKAP2O75563 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SKAP2O75563 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SKAP2O75563 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SKAP2O75563 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SKAP2O75563 KIFC3-211ENST00000562903 3221 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SKAP2O75563 BIRC5-202ENST00000350051 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SKAP2O75563 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SKAP2O75563 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SKAP2O75563 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SKAP2O75563 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SKAP2O75563 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SKAP2O75563 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SKAP2O75563 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SKAP2O75563 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SKAP2O75563 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SKAP2O75563 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SKAP2O75563 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms